1945 yılında Eskişehir’de doğdu. Temel üniversite eğitimini İTÜ’de Makina Mühendisliği alanında yaptı. İ.Ü. İşletme İktisadi Enstitüsü’nün uzmanlık programını 1968 yılında tamamladı. Devlet Planlama Teşkilatında 1968 ve 1972 yılları arasında proje değerlendirme uzmanı olarak çalıştı. Bu arada bir yıl İngiltere’de incelemelerde bulundu. Erzurum Üniversitesi’nde 1972’de akademik çalışmalara başladı. Görevini 1976’da Ankara SBF’ne aktardı. Doktora çalışmasını 1975’te bitirdi, 1987’de doçent, 1994’te profesör oldu. Maltepe Üniversitesi’nde öğretim üyesidir. Mavera dergisinin kurucularından olan Gürdoğan, evli ve üç çocuk sahibidir.
Yayınlanmış kitapları: Üretim Planlamasında Doğrusal Programlama ve Demir Çelik Endüstrisinde Bir Uygulama, 1981, Ticari ve Sosyal açıdan Proje Değerlendirme Yöntemleri, 1987, İşletmelerde Yatırım Yöntemi, 2004, Kirlenmenin Boyutları, 2010, Girişimcilik ve Girişim Kültürü, 2010, Teknolojinin Ötesi, 2011, Görünmeyen Üniversite, 2011, New York’tan Los Angeles’a Yeni Roma, 2011, Kültür ve Sanayileşme, Konuşmalar, 2012, İki Dünyanın Hesaplaşması, 2012, Zamanı Aşan fiehirler, 2013, Günler Akarken, 2013, Hicaz’dan Endülüs’e, 2013.